Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nsfl1cQ9CZ44 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nsfl1cQ9CZ44 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsfl1cQ9CZ44 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsfl1cQ9CZ44 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsfl1cQ9CZ44 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsfl1cQ9CZ44 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsfl1cQ9CZ44 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsfl1cQ9CZ44 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsfl1cQ9CZ44 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsfl1cQ9CZ44 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsfl1cQ9CZ44 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsfl1cQ9CZ44 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nsfl1cQ9CZ44 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsfl1cQ9CZ44 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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