Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb9Q9CQJ8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms