Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NenfQ9CQ45 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms