Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms