Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms