Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06344 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06344 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06344 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06344 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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