Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1348.3 ms