Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms