Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Utp23Q9CX11 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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