Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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