Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms