Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms