Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Foxd2O35392 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Foxd2O35392 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Foxd2O35392 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Foxd2O35392 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Foxd2O35392 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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