Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms