Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssxb2Q8C5Z3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms