Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arhgef17Q80U35 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arhgef17Q80U35 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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