Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc6aQ78XR0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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