Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ecm29Q6PDI5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ecm29Q6PDI5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ecm29Q6PDI5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ecm29Q6PDI5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm29Q6PDI5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ecm29Q6PDI5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ecm29Q6PDI5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ecm29Q6PDI5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ecm29Q6PDI5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ecm29Q6PDI5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ecm29Q6PDI5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm29Q6PDI5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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