Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec24aQ3U2P1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms