Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms