Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma4Q9R1P0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms