Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms