Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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