Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc50Q810U5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms