Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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