Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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COL19A1Q14993 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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