Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms