Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CastP51125 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CastP51125 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms