Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Speer3W4VSP1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Speer3W4VSP1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Speer3W4VSP1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Speer3W4VSP1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Speer3W4VSP1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer3W4VSP1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer3W4VSP1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms