Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms