Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt27Q9Z320 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt27Q9Z320 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt27Q9Z320 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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