Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl40Q9Z2Q5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms