Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mtmr1Q9Z2C4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtmr1Q9Z2C4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms