Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp1Q9Z273 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tulp1Q9Z273 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms