Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp4Q9Z1N6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms