Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phf1Q9Z1B8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf1Q9Z1B8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms