Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnip1Q9WUU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms