Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms