Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prkab1Q9R078 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms