Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Abt1Q9QYL7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Abt1Q9QYL7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abt1Q9QYL7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms