Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nufip1Q9QXX8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nufip1Q9QXX8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms