Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PdcQ9QW08 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PdcQ9QW08 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms