Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42ep4Q9JM96 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms