Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upk3aQ9JKX8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Upk3aQ9JKX8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms