Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap4m1Q9JKC7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms