Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESL0

Oxct2b, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2bQ9ESL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Oxct2bQ9ESL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Oxct2bQ9ESL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms