Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ParvbQ9ES46 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvbQ9ES46 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ParvbQ9ES46 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms