Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eif3fQ9DCH4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3fQ9DCH4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms