Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop7Q9DCH2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop7Q9DCH2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms