Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne8Q9DC53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms